تکرار غنی از لوسین

یک گونه از توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین
یک گونه از توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین
	یک گونه از توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین با یک ساختار جدید از پروتئین های تکرارشونده
شناسه‌ها
نماد	LRV
پی‌فم	PF01816
پی‌فم clan	CL0020
اینترپرو	IPR004830
SCOPe	1lrv / SUPFAM
پی‌فم
ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary

ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary
پی‌دی‌بی	1ogqA:155–177 1jl5A:358–382 1g9uA:358–382 1k5dF:123–149 2ca6A:123–149 1yrgA:123–149 1k5gF:123–149 1k15A:165–187 1m0zA:165–187 1u0nD:165–187 1qyyG:165–187 1sq0B:165–187 1m10B:165–187 1ookG:165–187 1k13A:165–187 1p9aG:165–187 1p8vA:165–187 1k14A:165–187 1ziwA:563–585 2a0zA:563–585 1wwlA:292–318 1p8tA:131–153 1oznA:131–153 1xum :54–75 1xcdA:131–149 1xecB:131–149 1xkuA:131–149 1xwdC:194–217 1xun :194–217 1o6sA:274–294 1kohB:292–315 1fo1B:292–315 1ft8D:292–315 1kooC:292–315 2bnh :337–360 1dfjI:337–360 1a4yD:114–137 2bexA:114–137 1z7xW:114–137 1dceA:509–532 1ltxA:509–532 1p95B:551–560 1xeuA:162–182 1m9lA:116–139 1ds9A:116–139 1m9sA:165–185 1h6tA:165–185 1otmA:165–185 1otoA:165–185 1d0bA:165–185 1otnA:165–185 1h6uA:209–229 1w8aA:596–618 1a9nA:89–109

	مثالی از یک پروتئین حاویِ توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین، یک بازدارنده ریبونوکلئاز در خوک
شناسه‌ها
نماد	LRR_1
پی‌فم	PF00560
پی‌فم clan	CL0022
اینترپرو	IPR001611
SCOPe	2bnh / SUPFAM
OPM protein	1xwd
پی‌فم
ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary
پی‌دی‌بی	1ogqA:155–177 1jl5A:358–382 1g9uA:358–382 1k5dF:123–149 2ca6A:123–149 1yrgA:123–149 1k5gF:123–149 1k15A:165–187 1m0zA:165–187 1u0nD:165–187 1qyyG:165–187 1sq0B:165–187 1m10B:165–187 1ookG:165–187 1k13A:165–187 1p9aG:165–187 1p8vA:165–187 1k14A:165–187 1ziwA:563–585 2a0zA:563–585 1wwlA:292–318 1p8tA:131–153 1oznA:131–153 1xum :54–75 1xcdA:131–149 1xecB:131–149 1xkuA:131–149 1xwdC:194–217 1xun :194–217 1o6sA:274–294 1kohB:292–315 1fo1B:292–315 1ft8D:292–315 1kooC:292–315 2bnh :337–360 1dfjI:337–360 1a4yD:114–137 2bexA:114–137 1z7xW:114–137 1dceA:509–532 1ltxA:509–532 1p95B:551–560 1xeuA:162–182 1m9lA:116–139 1ds9A:116–139 1m9sA:165–185 1h6tA:165–185 1otmA:165–185 1otoA:165–185 1d0bA:165–185 1otnA:165–185 1h6uA:209–229 1w8aA:596–618 1a9nA:89–109

توالی غنی از لوسین

اینترنالین اچ: ساختار کریستالی از دومین‌های آمیدی متصل‌به‌هم.

شناسه‌ها

نماد

LRR_adjacent

ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary

دومین انتهای آمینی غنی از توالی لوسین

دکورین دایمریک استخراج شده از بافت‌های گاوی، فُرم کریستالی ۲

شناسه‌ها

نماد

LRRNT

SMART

SCOPe

1m10 / SUPFAM

ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary

دومین انتهای آمینی غنی از توالی لوسین
ساختار کریستالی پروتئین مهارکنندهٔ پلی‌گالاکتوروناز (pgip)، نوعی پروتئین حاوی توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین که در دفاعِ ایمنی گیاهان نقش دارد.
شناسه‌ها
نماد	LRRNT_2
اینترپرو	IPR013210
SMART	LRRNT
SCOPe	1m10 / SUPFAM

دومین ابتدایی کربوکسیلی غنی از توالی لوسین

سومین دومِـین lrr در پروتئینِ slit مگس سرکه

شناسه‌ها

نماد

LRRCT

SMART

SCOPe

1m10 / SUPFAM

ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary

مجموعهٔ FeS4 از پروتئین LRV

یک گونه از توالی تکرارشوندهٔ غنی از لوسین با یم ساختار جدید از پروتئین های تکرارشونده

شناسه‌ها

نماد

LRV_FeS

پی‌فم clan

SCOPe

1lrv / SUPFAM

ساختارهای پروتئینی در دسترس:
پی‌فم	structures / ECOD
پی‌دی‌بی	RCSB PDB; PDBe; PDBj
پی‌دی‌بی‌سام	structure summary

تکرارهای غنی از لوسین (انگلیسی: Leucine-rich repeats) یک موتیف ساختاری پروتئین است که یک چین (تاشدگی) نعل‌اسبی α/β تشکیل می‌دهد.^[۱]^[۲] این موتیف از توالی تکرارشوندهٔ ۲۰ تا ۳۰ اسید آمینه تشکیل شده‌است که معمولاً دارای اسید آمینهٔ آب‌گریزِ «لوسین» است. این توالی تکراری معمولاً در هم چین می‌خورند و یک دومِـین سلنوئیدی پروتئین را می‌سازند که به آن اصطلاحاً «دومین تکرارشوندهٔ غنی از لوسین» می‌گویند. هر واحد تکرارشونده به‌طور رایج دارای ساختارِ «صفحه بتا-چرخش-مارپیچ آلفا» است و دومین ایجادشده هم دارای توالی تکرارشوندهٔ فراوان و شکلی نعل‌اسبی با یک صفحهٔ بتای موازی داخلی و مارپیچ‌های خارجی است. یک سمت از صفحهٔ بتا و مارپیچ در معرض حلال‌ها بوده و در نتیجه مملو از باقی‌مانده‌های آب‌دوست است. ناحیهٔ بین صفحات بتا و مارپیچ‌ها هم هستهٔ مرکزیِ آب‌گریزِ است که از لحاظ فضایی، به‌طور متراکمی از باقی‌مانده‌های لوسین احاطه شده‌است.

توالی غنی از لوسین بیشتر در ایجاد تعامل پروتئین-پروتئین نقش دارد.^[۳]^[۴]

منابع

↑ Kobe B, Deisenhofer J (October 1994). "The leucine-rich repeat: a versatile binding motif". Trends Biochem. Sci. 19 (10): 415–21. doi:10.1016/0968-0004(94)90090-6. PMID 7817399.
↑ Enkhbayar P, Kamiya M, Osaki M, Matsumoto T, Matsushima N (February 2004). "Structural principles of leucine-rich repeat (LRR) proteins". Proteins. 54 (3): 394–403. doi:10.1002/prot.10605. PMID 14747988.
↑ Kobe B, Kajava AV (December 2001). "The leucine-rich repeat as a protein recognition motif". Curr. Opin. Struct. Biol. 11 (6): 725–32. doi:10.1016/S0959-440X(01)00266-4. PMID 11751054.
↑ Gay NJ, Packman LC, Weldon MA, Barna JC (October 1991). "A leucine-rich repeat peptide derived from the Drosophila Toll receptor forms extended filaments with a beta-sheet structure". FEBS Lett. 291 (1): 87–91. doi:10.1016/0014-5793(91)81110-T. PMID 1657640.

بیشتر بخوانید

Tooze, John; Brändén, Carl-Ivar (1999). Introduction to Protein Structure (2nd ed.). New York: Garland Publishing. ISBN 0-8153-2305-0.
Wei T, Gong J, Jamitzky F, Heckl WM, Stark RW, Roessle SC (November 2008). "LRRML: a conformational database and an XML description of leucine-rich repeats (LRRs)". BMC Struct. Biol. 8 (1): 47. doi:10.1186/1472-6807-8-47. PMC 2645405. PMID 18986514.

پیوند به بیرون

ردهٔ موتیفی LIG_SCF_Skp2-Cks1_1 در مرجع موتیف خطی یوکاریوتیک

[pmid7817399-1] Kobe B, Deisenhofer J (October 1994). "The leucine-rich repeat: a versatile binding motif". Trends Biochem. Sci. 19 (10): 415–21. doi:10.1016/0968-0004(94)90090-6. PMID 7817399.

[pmid14747988-2] Enkhbayar P, Kamiya M, Osaki M, Matsumoto T, Matsushima N (February 2004). "Structural principles of leucine-rich repeat (LRR) proteins". Proteins. 54 (3): 394–403. doi:10.1002/prot.10605. PMID 14747988.

[pmid11751054-3] Kobe B, Kajava AV (December 2001). "The leucine-rich repeat as a protein recognition motif". Curr. Opin. Struct. Biol. 11 (6): 725–32. doi:10.1016/S0959-440X(01)00266-4. PMID 11751054.

[pmid1657640-4] Gay NJ, Packman LC, Weldon MA, Barna JC (October 1991). "A leucine-rich repeat peptide derived from the Drosophila Toll receptor forms extended filaments with a beta-sheet structure". FEBS Lett. 291 (1): 87–91. doi:10.1016/0014-5793(91)81110-T. PMID 1657640.

[۱]

[۲]

[۳]

[۴]