NEST (نرم افزار)

NEST (ابزار شبیه سازی عصبی)
نویسنده(های); اصلی	مارکوس دیزمن، مارک الیور گیوالتیگ، ابیگیل موریسون، هانس اکهارد پلسر
توسعه‌دهنده(ها)	The NEST Initiative
انتشار اولیه	۱ اوت ۲۰۰۴
انتشار پایدار	3.3 / ۲۲ مارس ۲۰۲۳
مخزن	github.com/nest/nest-simulator
نوشته‌شده با	C++، پایتون، سیتون
سیستم‌عامل	کراس پلت فرم
در دسترس به	انگلیسی
نوع	علوم اعصاب محاسباتی
مجوز	GPLv2+
وبگاه	www.nest-simulator.org

NEST یک نرم‌افزار شبیه‌سازی برای مدل‌های شبکه عصبی ، از جمله شبکه‌های عصبی در مقیاس بزرگ است. NEST در ابتدا توسط Markus Diesmann و Marc-Oliver Gewaltig توسعه داده شد و اکنون توسط NEST Initiative توسعه و نگهداری می شود.^[۱]^[۲]

فلسفه مدلسازی

شبیه سازی NEST سعی می کند منطق یک آزمایش الکتروفیزیولوژیکی را که در داخل یک کامپیوتر انجام می شود دنبال کند، با این تفاوت که سیستم عصبی مورد بررسی باید توسط آزمایشگر تعریف شود.^[۳]

سیستم عصبی با تعداد زیادی نورون و اتصالات آنها تعریف می شود. در یک شبکه NEST، مدل‌های مختلف نورون و سیناپس می‌توانند همزیستی داشته باشند. هر دو نورون می توانند چندین اتصال با خواص متفاوت داشته باشند. بنابراین، اتصال را به طور کلی نمی توان با یک وزن یا ماتریس اتصال توصیف کرد، بلکه به عنوان یک لیست مجاورت توصیف کرد.

برای دستکاری یا مشاهده پویایی شبکه، آزمایشگر می تواند وسایلی را تعریف کند که ابزارهای مختلف (برای اندازه گیری و تحریک) موجود در یک آزمایش را نشان می دهند. این دستگاه ها داده های خود را یا در حافظه یا فایل می نویسند.

NEST قابل توسعه است و می‌توان مدل‌های جدیدی برای نورون‌ها، سیناپس‌ها و دستگاه‌ها اضافه کرد.

منابع

↑ Rotter, Stefan; Diesmann, Markus (1999). "Exact digital simulation of time-invariant linear systems with applications to neuronal modeling". Biological Cybernetics. 81 (5–6): 381–402. doi:10.1007/s004220050570. PMID 10592015. S2CID 8124866.
↑ Brunel, Nicolas (2000). "Dynamics of Sparsely Connected Networks of Excitatory and Inhibitory Spiking Neurons". Journal of Computational Neuroscience. 8 (3): 183–208. doi:10.1023/A:1008925309027. PMID 10809012. S2CID 1849650.
↑ Morrison, Abigail; Straube, Sirko; Plesser, Hans Ekkehard; Diesmann, Markus (2007). "Exact Subthreshold Integration with Continuous Spike Times in Discrete-Time Neural Network Simulations". Neural Computation. 19 (1): 47–79. doi:10.1162/neco.2007.19.1.47. PMID 17134317. S2CID 8517223.

[1] Rotter, Stefan; Diesmann, Markus (1999). "Exact digital simulation of time-invariant linear systems with applications to neuronal modeling". Biological Cybernetics. 81 (5–6): 381–402. doi:10.1007/s004220050570. PMID 10592015. S2CID 8124866.

[2] Brunel, Nicolas (2000). "Dynamics of Sparsely Connected Networks of Excitatory and Inhibitory Spiking Neurons". Journal of Computational Neuroscience. 8 (3): 183–208. doi:10.1023/A:1008925309027. PMID 10809012. S2CID 1849650.

[3] Morrison, Abigail; Straube, Sirko; Plesser, Hans Ekkehard; Diesmann, Markus (2007). "Exact Subthreshold Integration with Continuous Spike Times in Discrete-Time Neural Network Simulations". Neural Computation. 19 (1): 47–79. doi:10.1162/neco.2007.19.1.47. PMID 17134317. S2CID 8517223.

[۱]

[۲]

[۳]