هولومایکوتا

هولومایکوتا
محدودهٔ زمانی: اردویسین میانه – امروزی ۴۶۰ تا ۰ میلیون سال پیش
خطای عبارت: عملگر < دور از انتظار
Nuclearia
رده‌بندی علمی e
کلاد: پشت‌تاژکان
(طبقه‌بندی‌نشده): هولومایکوتا
Liu و همکاران، ۲۰۰۹
گروه‌ها[۱]
مترادف
  • Nucletmycea Brown و همکاران، ۲۰۰۹[۲]
  • Holofungi
  • Fungida

هولومایکوتا یا نوکلت‌مایسه‌آ یک شاخه پایه‌ای از پشت‌تاژکان و شاخه خواهر همه‌زیان است. این شاخه شامل کریستیدیسکوئیدا و شاخه قارچ‌ها می‌باشد. جایگاه هسته‌دارسانان، آمیب‌های آزادزی تک‌سلولی و فاگوتروف،[۳] به‌عنوان نخستین شاخه‌تبار درون هولومایکوتا نشان می‌دهد که حیوانات و قارچ‌ها به‌طور مستقل چندسلولی‌شدن پیچیده را از یک نیای تک‌سلولی مشترک کسب کرده‌اند و سبک زندگی اسموتروفی (یکی از ویژگی‌های بارز قارچ‌ها) در مراحل بعدی واگرایی این شاخه یوکاریوتی پدید آمده است. پشت‌هاگان یک گروه آرایه‌شناختی تازه‌پیشنهادشده است که افلیدها،[۴] میکروسپوریدیا و کریپتومایکوتا را در بر می‌گیرد، که سه گروه از انگل‌ها هستند.[۵]

روزلا (از گروه کریپتومایکوتا) نخستین سرده قارچی شناخته‌شده است که در برخی مراحل چرخه زندگی آن، کیتین دیده شده است،[۵] با این‌که دیواره سلولی کیتینی (ویژگی دیگر قارچ‌ها) و اسموتروفی از نیای مشترک بلاستوکلادیومیست‌ها و کیتریدیومیست‌ها سرچشمه گرفته‌اند؛ گروه‌هایی که هنوز برخی ویژگی‌های نیایی مانند داشتن تاژک در مرحله زوئوسپور را حفظ کرده‌اند.[۶] گروه‌هایی از قارچ‌ها که دارای رشد هیفی هستند مانند زوپاگومیست‌ها، قارچ‌های سنجاقی و دوهستگان، از یک نیای مشترک حدوداً ۷۰۰ میلیون سال پیش پدید آمده‌اند.[۶] زوپاگومیست‌ها عمدتاً پاتوژن جانوران یا قارچ‌های دیگرند، موکورومیست‌ها گروهی گوناگون‌تر هستند که شامل انگل‌ها، ساپروتروف‌ها یا قارچ‌های همزیست بیرونی می‌شوند.[۵] دوهستگان گروهی است که آسکومیست‌ها و قارچ‌های چتری را در بر می‌گیرد که حدود ۹۸٪ از گونه‌های توصیف‌شده قارچ‌ها را شامل می‌شوند.[۶] به‌سبب این تنوع گسترده، دوهستگان گروه‌هایی با تفاوت‌های ریخت‌شناختی فراوان را شامل می‌شود، از نخینه یا مخمرهای تک‌سلولی (مانند ارگانیسم مدل ساکارومایسس سرویزیه) تا قارچ‌های پرسلولی پیچیده که به نام قارچ‌های چتری شناخته می‌شوند.[۶] برخلاف جانوران و گیاهان خشکی با چندسلولی‌شدن پیچیده، روابط تبارزایی استنباط‌شده نشان می‌دهند که قارچ‌ها در طول فرگشت آسکومیست‌ها و قارچ‌های چتری چندین بار چندسلولی‌شدن را به‌دست آورده و از دست داده‌اند.[۷]

تبارزایی

درخت تبارزایی قارچ‌ها و روابط نزدیک آن‌ها با دیگر موجودات را بر اساس کار فیلیپ سیلار[۸] و کتاب «مایکوتا: رساله‌ای جامع دربارهٔ قارچ‌ها به عنوان سامانه‌های تجربی برای پژوهش‌های بنیادی و کاربردی» ترتیب بندی شده است.[۹][۱۰] درخت تبارزایی هولومایکوتا مطابق با پژوهش‌های تدروسو و همکاران است.[۱۱][۱۲][۱۳]

پشت‌تاژکان
هولومایکوتا
کریستیدیسکوییدا

فونتیکولیدا

نوکلارییدا

قارچ‌ها/

BCG2

فتوفاژئا

قارچ‌های حقیقی

آفلیدا

BCG1

روزلومایکوتا/

روزلا

ناماکو-۳۷

میکروسپوریدیا

متچنیکووِلا

میکروسپورئا

کریپتومایکوتا/اوپیستوفاژیا
پشت‌هاگان
همه‌زیان

ایختیوسپورئا

پلی‌فورمئا

کورالوکتیریوم

سیسوموناس

ریسه‌زیان

فیلاستره‌آ

قیف‌زیان

قیفی‌تاژک‌داران

جانوران

منابع

  1. Adl, Sina M.; Simpson, Alastair G. B.; Lane, Christopher E.; Lukeš, Julius; Bass, David; Bowser, Samuel S.; Brown, Matthew W.; Burki, Fabien; Dunthorn, Micah; Hampl, Vladimir; Heiss, Aaron; Hoppenrath, Mona; Lara, Enrique; Le Gall, Line; Lynn, Denis H.; McManus, Hilary; Mitchell, Edward A. D.; Mozley-Stanridge, Sharon E.; Parfrey, Laura W.; Pawlowski, Jan; Rueckert, Sonja; Shadwick, Laura; Schoch, Conrad L.; Smirnov, Alexey; Spiegel, Frederick W. (2012). "The Revised Classification of Eukaryotes". Journal of Eukaryotic Microbiology. 59 (5): 429–514. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872. PMID 23020233.
  2. Brown MW, Spiegel FW, Silberman JD (December 2009). "Phylogeny of the "forgotten" cellular slime mold, Fonticula alba, reveals a key evolutionary branch within Opisthokonta". Mol. Biol. Evol. 26 (12): 2699–709. doi:10.1093/molbev/msp185. PMID 19692665.
  3. López‐Escardó, David; López‐García, Purificación; Moreira, David; Ruiz‐Trillo, Iñaki; Torruella, Guifré (2017-08-12). "Parvularia atlantis gen. et sp. nov. , a Nucleariid Filose Amoeba (Holomycota, Opisthokonta)". Journal of Eukaryotic Microbiology. 65 (2): 170–179. doi:10.1111/jeu.12450. ISSN 1550-7408. PMC 5708529. PMID 28741861.
  4. Karpov, Sergey; Mamkaeva, Maria A.; Aleoshin, Vladimir; Nassonova, Elena; Lilje, Osu; Gleason, Frank H. (2014). "Morphology, phylogeny, and ecology of the aphelids (Aphelidea, Opisthokonta) and proposal for the new superphylum Opisthosporidia". Frontiers in Microbiology. 5: 112. doi:10.3389/fmicb.2014.00112. PMC 3975115. PMID 24734027.
  5. 1 2 3 Berbee, Mary L.; James, Timothy Y.; Strullu-Derrien, Christine (2017-09-08). "Early Diverging Fungi: Diversity and Impact at the Dawn of Terrestrial Life". Annual Review of Microbiology. 71 (1): 41–60. doi:10.1146/annurev-micro-030117-020324. PMID 28525299.
  6. 1 2 3 4 Stajich, Jason E.; Berbee, Mary L.; Blackwell, Meredith; Hibbett, David S.; James, Timothy Y.; Spatafora, Joseph W.; Taylor, John W. (2009-09-29). "The Fungi". Current Biology. 19 (18): R840–R845. doi:10.1016/j.cub.2009.07.004. PMC 2913116. PMID 19788875.
  7. Nguyen, Tu Anh; Cissé, Ousmane H.; Wong, Jie Yun; Zheng, Peng; Hewitt, David; Nowrousian, Minou; Stajich, Jason E.; Jedd, Gregory (2017-02-08). "Innovation and constraint leading to complex multicellularity in the Ascomycota". Nature Communications. 8: ncomms14444. Bibcode:2017NatCo...814444N. doi:10.1038/ncomms14444. PMC 5309816. PMID 28176784.
  8. Silar P (2016). Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes. HAL. p. 462. ISBN 978-2-9555841-0-1.
  9. Esser K (2014). The Mycota VII A: Systematics and Evolution (2nd ed.). Springer. p. 461. ISBN 978-3-642-55317-2.
  10. Bass, David; Czech, Lucas; Williams, Bryony A. P.; Berney, Cédric; Dunthorn, Micah; Mahé, Frederic; Torruella, Guifré; Stentiford, Grant D.; Williams, Tom A. (2018-04-28). "Clarifying the Relationships between Microsporidia and Cryptomycota". Journal of Eukaryotic Microbiology (به انگلیسی). 65 (6): 773–782. doi:10.1111/jeu.12519. ISSN 1066-5234. PMC 6282948. PMID 29603494.
  11. Tedersoo, Leho; Sánchez-Ramírez, Santiago; Kõljalg, Urmas; Bahram, Mohammad; Döring, Markus; Schigel, Dmitry; May, Tom; Ryberg, Martin; Abarenkov, Kessy (2018). "High-level classification of the Fungi and a tool for evolutionary ecological analyses". Fungal Diversity (به انگلیسی). 90 (1): 135–159. doi:10.1007/s13225-018-0401-0. hdl:10138/238983. ISSN 1560-2745.
  12. Lopez-Garcia, Purificacion; Volcker, Eckhard; Sebe-Pedros, Arnau; Burns, John; Karpov, Sergey A.; Moreira, David; Grau-Bove, Xavier; Torruella, Guifre (2018-08-17). "The aphelid-like phagotrophic origins of fungi". bioRxiv (به انگلیسی): 233882. doi:10.1101/233882.
  13. Galindo, Luis Javier; Torruella, Guifré; López-García, Purificación; Ciobanu, Maria; Gutiérrez-Preciado, Ana; Karpov, Sergey A; Moreira, David (2022-07-28). "Phylogenomics Supports the Monophyly of Aphelids and Fungi and Identifies New Molecular Synapomorphies". Systematic Biology.