تصویری از مدل ویروس آنفلوانزا، از دیتابیس ان سی بی آی
مرکز ملی اطلاعات زیستفناوری (به انگلیسی : National Center for Biotechnology Information ) معروف به NCBI یکی از مراکز و شاخههای کتابخانه ملی پزشکی ایالات متحده آمریکا است که خود زیرمجموعه موسسه ملی سلامت NIH قرار دارد. مؤسسه ملی سلامت در نهایت زیر مجموعه وزارت بهداشت و خدمات انسانی ایالات متحده آمریکا است. این مرکز در سال ۱۹۸۸ در پی تصویب طرح پیشنهای سناتور کلود پپر در کنگره آمریکا شکل گرفت. مرکز ملی اطلاعات زیستفناوری در شهر بتزدا در ایالت مریلند قرار دارد.
در این مرکز ابزار و پایگاه دادههایی نظیر آنتره ، بلاست ، پابمد و ژنبانک اداره میشود.
از وظایف مرکز ان سی بی آی میتوان موارد زیر را نام برد[ ۱] :
ایجاد ساختار برای تحلیل و ذخیرهسازی دادههای تحقیقات ژنتیک ، بیوشیمی ، و زیستشناسی مولکولی .
ترویج و شیوع استفاده از این دیتابیسها در میان جامعه محققان
هماهنگAS
BLAST (مخفف Basic Local Alignment Search Tool) یکی از معروفترین ابزارهای بیوانفورماتیکی است که توسط NCBI توسعه داده شده است. این ابزار برای مقایسه توالیهای زیستی مانند DNA، RNA یا پروتئین استفاده میشود و شباهت بین توالیها را جستجو میکند.
پیوند به بیرون
پایگاههای داده
Sequence databases: ژنبانک , European Nucleotide Archive and DNA Data Bank of Japan
Secondary databases: یونیپروت , database of protein sequences grouping together یونیپروت , یونیپروت and Protein Information Resource
Other databases: بانک داده پروتئین , پروژه پایگاه داده ژنوم آنسامبل and اینترپرو
Specialised genomic databases: BOLD, Saccharomyces Genome Database, FlyBase, VectorBase, WormBase, Rat Genome Database, PHI-base, Arabidopsis Information Resource and Zebrafish Information Network
نرمافزارها
بلاست
Bowtie
کلاستال
EMBOSS
HMMER
MUSCLE
SAMtools
SOAP suite
TopHat
سایر مؤسسات
Broad Institute
China National GeneBank (CNGB)
Computational Biology Department (CBD)
Microsoft Research - University of Trento Centre for Computational and Systems Biology (COSBI)
Database Center for Life Science (DBCLS)
DNA Data Bank of Japan (DDBJ)
European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI)
European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
Flatiron Institute
J. Craig Venter Institute (JCVI)
Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics (MPI-CBG)
مرکز ملی اطلاعات زیستفناوری (NCBI)
مؤسسه ملی ژنتیک (ژاپن)
Netherlands Bioinformatics Centre (NBIC)
Philippine Genome Center (PGC)
مؤسسه پژوهشی اسکریپس
Swiss Institute of Bioinformatics (SIB)
Wellcome Sanger Institute
Whitehead Institute
سازمانها
African Society for Bioinformatics and Computational Biology (ASBCB)
Australia Bioinformatics Resource (EMBL-AR)
European Molecular Biology network (EMBnet)
International Nucleotide Sequence Database Collaboration (INSDC)
International Society for Biocuration (ISB)
International Society for Computational Biology (ISCB)
Student Council (ISCB-SC)
Institute of Genomics and Integrative Biology (CSIR-IGIB)
Japanese Society for Bioinformatics (JSBi)
اجلاسها
Basel Computational Biology Conference ([BC2 ])
European Conference on Computational Biology (ECCB)
Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
International Conference on Bioinformatics (InCoB)
ISCB Africa ASBCB Conference on Bioinformatics
Pacific Symposium on Biocomputing (PSB)
Research in Computational Molecular Biology (RECOMB)
فرمتهای فایلی
CRAM format
قالب فستا
قالب فستک
NeXML format
Nexus format
Pileup format
SAM format
Stockholm format
VCF format
موضوعات مرتبط
↑ Bioinformatics basics: applications in biological science and medicine . Hooman H. Rashidi, Lukas K. Buehler. Publisher CRC Press, 2000. ISBN 0-8493-2375-4 pp.34-44